安庆地势依山傍水，南濒大江，北倚龙山，东经菱湖。菱湖是一个方圆仅十几里的小湖，有水道与枞阳相通，并可由枞阳进入长江，但枞阳在半年前就已被湘军攻克，所以安庆守军无法经由枞阳入江。

在曾国荃部和湘江水师的围困下，安庆城只有通过菱湖与外界交通，城内守军也经常用小船偷运米粮入城。1861年4月29日，陈玉成在菱湖北岸的中空地带筑垒十三座，安庆守将叶芸来隔湖呼应，在南岸筑垒五座，两边用小船进行联络。

从5月1日起，由陈玉成亲自督军，城外太平军分成十余路猛扑曾部外壕，叶芸来同时对内壕进行突击。曾国荃除依壕坚守外，另请水师将长江中的二十余艘炮船抬入内湖，用以阻遏太平军内外部的联系。

在水勇抬船入湖的过程中，曾国荃派战将萧孚泗出壕护卫。太平军发现后立即对萧部予以包围，幸亏曾国葆拼死援救，才把萧孚泗救出来。此后抬入内湖的炮船开始进行巡弋，太平军的小船不断遭到攻击。

陈玉成在水上没有反击能力，只能在陆上加强攻击，希望能够逐步控制菱湖四围，打破湘军水陆结合的封锁线。之后太平军所筑营垒日益增多，直逼湘军营垒，经与众将商议，曾国荃决定派曾国葆在东路湖边筑垒，以进一步遮护水师。

陈玉成非常清楚湖边筑垒对己方造成的威胁，他对部下说：“清妖（此处指湘军）若于东路筑垒，可制我死命，不可不争。”随即组织敢死队出击，竭力阻挠湘军筑垒。湘军则一边筑垒一边抵抗，最后曾国葆率部用一昼夜的工夫就筑成了湖边营垒。太平军功亏一篑，城内城外无法再顺利通过小船进行联系。

这时陈玉成所企盼的援军已纷纷赶到。就在安庆之战打响的第一天，干王洪仁玕、章王林绍璋抵达桐城，二人会同庐江守将吴如孝，率两万人马自桐城南下。多隆阿闻报，急忙予以阻击。

在太平天国