淮阳镇正式编入淮东军司步军司，编为北军淮阳军，凤离营、长山营、崇城步营、津海营都升格为军，林缚也在淮阳军旅营两级推广军令官及指挥参军的制度，在作战指挥、日常训练、后勤补给等问题上协助主将，也是让淮东将官借这个机会，大规模的编入淮阳军体系之内，正式的彻底的融合淮阳军。

林缚的头衔也较以往不同，更改为彭城郡公兼长山、凤离、崇城、津海、淮阳及靖海诸军都统制，兼领浙东、淮东、徐州制置使，兼领海陵知府，加兵部右侍郎衔等等，林缚每回看到自己长长的头衔，都会忍不住皱半天眉头。

刘妙贞乃愿为将领兵，出任淮阳军都指挥使，李良为指挥副使，编五旅二十五营步甲、五营轻骑、一营甲骑，兵额共计一万九千卒；此时编徐州行营军，以马兰头为都指挥使，柳西林为指挥副使，共编二十营步卒。

在淮东军司的体制里，凤离、长山、崇城、津海、淮阳为军司直接掌握的主力军，行营军为地方卫戍军。

以徐州城为界，外围的城垒寨堡，包括沛县、淮阳、徐州、广戚等城，位于整个徐泗防线的外围，战事激烈，主要由淮阳军负责防守，行营军协防；而位于徐州城以南、以东的睢宁、豫宿、沂州等城，则相对处于较为安全的防线内侧，则主要由行营军驻守。

通过这种部署，将有限的兵力及兵甲、军械资源有效的分配下去，形成更稳固的防线。

除了加强以徐州城为核心的外围防寨外，还在徐州城北、广戚与沛县之间的微山湖中择岛筑水寨，以杨释为将，从靖海第三水营调一旅水军及战船进入微山湖，作为徐泗外围防线的一个极重要的补充。

此外近三万辎兵则部署在徐州、淮阳、沛县、广戚、下邳、沂州、睢宁等地，平时负责城池修缮及协助地方修造沟渠、桥梁、道路以恢复生产，并在沛县、广戚等外围防寨周围进行军囤，以弥补军养不足。