计划中，为了补充战力，人类将利用迪迦之地留下的奥特曼的石像碎块，来研究奥特战士的力量，使得这种力量为人类所用。

超古代遗迹露露耶，是迪迦奥特曼与邪神加坦杰厄的最终决战之地。

它随着邪神加坦杰厄的现世而出现在世人面前。

而也正因为如此，它被tpc列入了f计划的考察研究对象中。

为了稳定大局，同时也是心中隐隐有些不安。

胜利队的居间惠队长主动请缨作为随行研究人员之一跟随考察队来到了露露耶中进行勘察。

而后，他们在这里发现了3000万年前的三大黑暗巨人的石像。

卡蜜拉！

达拉姆！

希特拉！

居间惠因为体内的3000万年前地球警备团团长幽怜的基因，而感知到了这三大黑暗巨人拥有毁灭地球的能力和邪恶，于是希望炸掉石像免除后患。

但却被阻止了。

这时，三大黑暗巨人复苏！

考察队除居间惠外无一生还！

三大黑暗巨人还释放出了他们饲养的魔鸟——小型佐加，企图让世界的天空再度笼罩在灭亡的黑暗中。

危急之时，居间惠体内的幽怜基因在遗迹的作用下苏醒，出手封印了遗迹，挡住了佐加们和三大黑暗巨人的去路。

另一方面，大古正在和丽娜一起旅行恋爱，他们即将步入婚姻的殿堂。

然而，在遗迹事件发生后，大古却经常会出现很离奇的梦和幻觉。

比如，大古带着丽娜，和野瑞以及新城的妹妹真由美一起去海洋馆游玩。

交谈时，大古说到自己正在发放婚礼请柬，却在耳边听到了卡蜜拉的声音，转头看到卡蜜拉笑着问他，为什么不给她也发一份请柬？

紧接着，三大黑暗巨人和无数小型佐加前来摧毁城