总督府的设置，徐泽对海军司下设的舰队也做了调整，在原本黄海、渤海、东海三支舰队的基础上，再增加一支靖海舰队。

四支舰队的分别部署如下：

靖海舰队。

驻地胶即湾，为同舟社总部直属，舰首阮小七。

主要任务为巡护京东东路东南洋面，监控赵宋涟水军水师。

渤海舰队。

驻地海连州镇东关，隶属于辽东巡抚府，舰首张顺。

主要任务是巡护渤海洋面，监控金国、辽国及赵宋沿海船只，封锁金、辽两国与赵宋之间的海上联系。

黄海舰队。

驻地由江华岛移至耽罗岛，隶属于黄海都护府，舰首时荼丹。

主要任务为监护高丽、日本以及琉球群岛北岛，维护同舟社在三地的利益；

东海舰队。

驻地海东郡藩州，隶属于海东总督府，舰首熊蒙。

主要任务为巡护海东周边洋面，监控赵宋明州水师。

另外，同舟社下辖的两块飞地天南寨和山南国也各有拓展。

郑天寿在麻六甲天南寨经营转口贸易数年，颇有收获。

不仅辗转送来了三匹阿拉伯种马，还搜集了一批外域书籍和一个翻译，其中就有徐泽最想要的《几何原本》。

经过数年的发展，天南寨也变成了天南城。

为了此事，还与当地土著爆发过冲突，数千土著围住了正在扩建中的天南城。

结果，发起围攻的土著头人被寨墙上的四门火炮（徐泽派人送去的火炮成品，没火药配方，用一点少一点）集火轰击，当场成为一摊肉泥。

目睹如此恐怖的一幕，土著兵卒疑是异族操纵神雷伐世，竟吓得跪地求饶。

经此一战，天南城控制的范围增大数倍，郑天寿已经管辖不过来了，请求总部派人支援。