道光肩上所要承受的重量，不比当年的乾隆轻多少。在张格尔叛乱中，裹从的回民超过数万，这让他感到十分不解。因为自祖父平定“大小和卓叛乱”后，中央政府在南疆实施的一直是轻徭薄赋政策，真是没向当地人收多少税，征多少役，新疆回部也“久已习为恭顺”，渐渐地服从中央政府了，怎么他们又突然会被张格尔所利用呢？

道光敏锐地察觉出了蹊跷，他随即下令内阁首席、文华殿大学士长龄负责查访。经过调查，长龄确认原喀什噶尔参赞大臣斌静贪横不法，民愤极大，是导致张格尔乘隙作乱的间接诱因。斌静被迅速革职拿问，由刑部按照“激变良民”律处以斩监候，后交宗人府“永远圈禁”，这就是震惊朝野的“斌静案”。

道光宣布，对叛乱分子区别对待，胁从者如果能解甲归降，就予以赦免，各归各家，只对一条道走到黑的予以严惩，这就等于最大限度地孤立了张格尔。