意味着南北士人对这一方略的分歧基本上得到了弥合，并开始贯彻实施，整个进程就迅速推动起来了。

朝廷新设登莱总督衙门，对于王子腾这种武勋出身的重臣出任登莱总督，沈有容没什么看法。

王子腾多年的京营节度使和宣大总督经历，加之他不但在元熙帝时深受重用，同时在进入永隆帝时代之后，一样未失宠于新皇，这样的人物出任登莱总督并不算坏事，起码在王子腾从朝廷弄来百万两银子打造登莱总督区时，沈有容甚至是十分振奋和支持的。

但是没想到王子腾虽然弄回来如此多的银子，但是却一门心思花在了整合登莱卫镇和登莱军上，对于码头、船厂和水师舰队的建设几乎无暇顾及，这和当时朝廷设立登莱总督的意图完全不符合。

沈有容听冯紫英介绍过，朝廷设立登莱总督的目的有三个。

第一，打造一支强大精锐的水师舰队，能够控制整个渤海乃至黑水洋和西大海，确保运输船队可以在环渤海和朝鲜任何一处登陆靠岸，这个登陆靠岸当然不单单指货物，更是指军队。

第二，尽快找到、熟悉和打通通往鲸海和虾夷地的航线，并力争控制和掌握这些航线和鲸海、虾夷地，最终实现通过海上航线联结包括乞列迷人在内的东海女真，完成对建州女真的夹击目的。

第三，建立一支精悍的登莱军，作为未来蓟辽总督麾下两镇军队的坚强后盾。

这三个目的的是又先后顺序的，第一个毫无争议的是要摆在第一位的，那么从码头到船厂的建设是首当其冲的，然后就该是水师舰队的建设，舰船、火炮和水师士卒，这几者缺一不可。

第二和第三个目的都是建立在第一个目的顺利推进的前提下才能谈得上，要打通航线控制海域，都需要水师舰队，同样登莱军打造出来也主要是要通过水师船队运送到环渤海湾任何一处登陆对辽东镇和蓟镇予以支援。