清康熙二年、明永历十七年六月，江南的明军和山东的清军形成一种奇怪的对峙。因为担心明军攻击南京、扬州、苏州等要害地区，山东的清军积极进行着南征的准备，本来应该输送向胶东前线的大量辎重也没有送去，而是被船舟和车辆运往淮安方向，胶东前线只是保证了必要的粮草；而明军对清军的动向也有所察觉，邓名把大营移动到了镇江，和第二次东征时一样立营于运河对岸。

六月下旬，得知明军显露出封闭运河的姿态后，清军在山东的攻势变得更加乏力，从燕京赶来的后援依旧源源不断地进入山东，不过这成千上万的清兵看都没有看胶东一眼，径直向南沿着运河前进；就是原先包围于七的部队，也有少量奉命赶回运河沿岸。

漕运总督林启龙已经向燕京报告，邓名此番入寇，总兵力可能超过十万，披甲在四万以上。虽然总人数还比不上郑成功和张煌言联合入侵长江那次，但甲士人数基本持平。听说明军动员的规模如此之大，还在镇江竖起了大营，燕京更加怀疑邓名有隔绝南北，寻找机会在江南立足的计划。

不过蒋国柱的报告中称南京还没有受到攻击，因此清廷也没有命令部队全速前进增援南京——邓名在之前的历次战役中表现出了惊人的战斗力，燕京无意让部队一支支去送死，而且现在明军还有控制长江的实力。所以燕京异常持重，一面缓缓在鲁南、淮北集中野战部队，一面保持和南京、扬州的通讯，如果邓名全力围攻南京，那援军才会趁邓名无暇分神时一举渡江。

而差不多在同时，刘体纯、王光兴带领他们的本部兵马渡过长江，在运河入口处不远扎下营寨。得知清军在山东放缓了攻势后，明军判断清军大举南下的可能姓越来越大，因此明军进一步增强了对运河的控制。一旦得到清军主力南征的消息，明军就会全数北上应战。运河是清军主力最快捷的行军和运输辎重的通道，对明军来说也是一样。