郑成功攻打崇明岛，就是为了能够把家属安置在这里，外面有水师环绕可保无忧，这样闽军就有机会腾出手来与清军再决胜负。但迟迟拿不下崇明岛，只会让士气不振的明军变得更加趋于瓦解。郑成功得知梁化凤、管效忠等人已经到达苏州府，现在虽然他们慑于明军水师的优势不敢增援崇明岛，但郑成功同样不敢冒险，万一清军偷渡成功，以现在明军的状况，恐怕又会是一场类似南京城下的大败。

放弃攻打崇明岛后，闽军就不可能再回头支援浙军，也会失去对清军的牵制作用。郑成功虽然顾不上再管张煌言，但他决定还是分批从崇明岛撤退，有断后部队就不会被清军水师追击，也可以把苏州的清军多拖上几天——郑成功觉得对深陷内地的浙军帮助不大，只能算聊尽人事而已。

虽然这次出击南京的结果与郑成功所期望的完全不同，还损失了甘辉、余新等许多将领，但郑成功已经开始从负面情绪中摆脱出来。

在几个亲卫的陪伴下，郑成功走到海边。远望南岸，密密麻麻的火光都是清军营地的。郑成功的背后隐隐传来明军家属的哭声，她们在哀悼今天战死的亲人——由于没能肃清崇明岛的敌军，所以郑军依旧没能完成军属分离工作。

“荷兰人劫掠我国客商，我已经警告过他们两次了，说如有再犯必定兴兵讨伐。”郑成功在心里静静地想着未来的战略。为了建立这支军队，郑成功花了差不多十年的时间。这次损失虽然不小，但以现在郑成功控制的海贸航线，估计有个五年也就能恢复旧观：“但荷兰人听闻我失败，难免会再起抢夺之心。如果我对他们劫掠汉家的商船置之不理，很快我的收入就会大减；反过来，如果我征讨台湾，拿下荷兰人的基地，以后澎湖、台湾之间的航道收入就不再是我与荷兰人共享，而是为我所独占……虽然这也要花费一些时间，但五年之内我依旧可以恢复军力，而且还多了一个台湾，可以用来安置家属