对于这些船长们的意见，吕万并不是完全赞成，因为他以前在航海学院中知道，在某些特殊的情况下，指南针会出现一些失灵现象，虽然遇到这种情况的机率很小，但也不是没有，所以他更倾向于在原地呆几天，等到天晴辩明了方向再走也不迟。只是看现在这种情况，谁也不知道什么时候会放晴，所以最后吕万只得尊重大多数人的选择，按照指南针指示的方向前行。

然而事实证明，有时候真理并不掌握在多数人手中，吕万他们的船队按照指南针指示的方向前进了十二天，到了第十三天的早上，天空的乌云终于散了，而这时吕万他们才发现，自己前进的方向并不是正东方，而是东北方向，也就是说，洋流一直是向正东没错，反而是指南针出了问题，导致他们已经偏离了航向。

这下让吕万他们大为懊恼，不过事情既然已经发生，再懊恼也没有用，最后经过测量后，搞清楚自己所在的经纬度，结果发现他们偏离还不算太远，认准了方向后，终于在十天之后再次回到原来的航线上，而更加巧合的是，当他们回到原来航线上时，指南针竟然恢复了正常。

对于这次偏离航线的事故，吕万详细的记录在航海日记上，只是以当时的技术手段，他们并不知道指南针失灵的原因，直到一百多年后，才有一位汉人中的天文学家给出了答案，原来当时那段时间刚好处于太阳黑子的爆发期，结果影响到了地球磁场，才使得整个船队的所有指南针失灵，甚至差点导致吕万这次探索之旅的失败。

另外值得一提的是，吕万这次偏离航线其实还有一个十分遗憾的地方，因为他们若是沿着原来的方向再向前走上一两天的话，那么就会有一个巨大的发现，可惜却被他们错过了，直到他们在回航时，才终于知道自己犯了一个大错误。

因为这次偏离航线事故，使得吕万他们在海上浪费了二十多天的时间，哪怕后来他们的船再次回到原来